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福建農信網銀助手可選擇模塊為：賬務處理、出納賬、輔助核算（預算科目支持）、報表、固定資產、往來賬齡分析、現金流量表、成本核算、進銷存、集團賬務與集團報表、工資、銀行賬戶管理與撥款。
企業賬務：
使用保會通財務軟件會計賬務處理模塊可以實現企業的現金收付核算、材料購進領用核算、材料成本差異計算和分攤、制造費用歸集和分配、產品成本歸集和計算、產品（商品）銷售收入和稅金計算、往來款項結算、產品銷售成本和費用核算、管理費用財務費用核算、所得稅計算、經營成果核算等所有會計核算。
使用固定資產模塊可以管理固定資產、計提折舊。使用報表模塊可以自動生成各種會計報表。使用工資模塊可以核算工資。使用單式賬模塊可以處理日記賬、備查賬。開放的數據接口，所有數據、表格支持導出，包括Excel、TXT、Access等接口方式，部份數據支持導入。字段內容可以進行靈活地選擇設置。軟件支持導出國際標準GB/T 19581-2004會計核算軟件標準接口數據，可以和任何一種支持本標準的軟件進行數據交換。如審計接口、稅務接口、財政接口、銀行接口等等。軟件支持財政部制訂的“中國財務軟件數據接口標準CSIA/ABM 98001號”。可以和任何一種支持本標準的財務軟件進行數據交換。
行政事業賬務：
保會通財務軟件應用于行政事業單位會計核算和財務管理，成效明顯。
1、賬務處理功能完備、直觀好用。
2、使用專門的輔助核算模塊來處理行政事業單位的收入、支出。
3、具有專門的收支表生成模板，用它來生成收支表可以自定義報表樣式、動態生成數據行，具有無以倫比的抗科目變動性功能。眾所周知：財政《預算收支科目》一年一變，收支報表逢變得變，會計人員談變色變。保會通財務軟件的獨到之處在于：抗變。
4、具有獨特的分單位核算、匯總功能，使用它可以輕松地應對成系統的單位的賬務和報表。如：核算中心、財政零戶統管、農村財務“雙代管”、教育衛生農林水系統上劃縣級后的財務管理……5、使用“單式賬”模塊來處理日記賬、備查賬、流水賬。
6、“工資”模塊具有優秀的工資管理和核算功能。使用它可以打印工資單、自動生成工資發放憑證。
7、軟件還集成了通用電子表格模塊，使用它既象Excel表一樣方便，又可以隨心所欲地自動向賬簿取數。
8、使用固定資產模塊可以管理固定資產、計提折舊。
9、開放的數據接口，所有數據、表格支持導出，包括Excel、TXT、Access等接口方式，部份數據支持導入。字段內容可以進行靈活地選擇設置。
10、軟件支持導出國際標準GB/T 19581-2004會計核算軟件標準接口數據，可以和任何一種支持本標準的軟件進行數據交換。如審計接口、稅務接口、財政接口、銀行接口等等。
11、軟件支持財政部制訂的“中國財務軟件數據接口標準CSIA/ABM 98001號”。可以和任何一種支持本標準的財務軟件進行數據交換。
